1. Título: Estimating abundance at age with Bayesian geostatistics and compositional data analysis
2. Autores:
   • Ernesto Jardim
   • Paulo Justiniano RIBEIRO JUNIOR
3. Periódicos:
   • resubmissão após contacto com editor: Canadian Journal of Fisheries & Aquatic Sciences (CJFAS)
     • submetido: ToDo

• arquivos fonte

1. Título: Estimating abundance at age with Bayesian geostatistics and compositional data analysis
2. Autores:
   • Ernesto Jardim
   • Paulo Justiniano RIBEIRO JUNIOR
3. Periódicos:
   • 1a submissão: Canadian Journal of Fisheries & Aquatic Sciences (CJFAS)
     • submetido em 24/Jan/2008, Texto Submetido: versão submetida
     • Status: rejeitado pelos editores (ver abaixo)
     • Pedido de reconsideração e reavaliação feito por Ernesto e aceito em 10/04/2008
     • arquivos fonte versão 20080411
     • arquivo com sugestões de PJ, 17/04/2008, 22:40 (BRT)

Dear Dr. Jardim,

20383 - Estimating abundance at age with Bayesian geostatistics and compositional data analysis

We very much regret that we cannot consider this manuscript for publication in CJFAS. The problem concerns a conflict with our editorial policy, and does not reflect upon the quality of your science. Upon receipt of your submission, we sought advice from an Associate Editor. The consensus is that, while we recognise the importance of the study, it presents a heavier emphasis on the statistics and modelling than we typically consider for CJFAS, and therefore we believe it would be better suited to a journal such as Biometrics.

It has become evident that we must restrict the scope and size of the Journal in some way, while trying to preserve its general multi-disciplinary character. The most equitable solution, we believe, is to refer to other more specialised outlets reports that are basically descriptive, or whose novelty relates only to new data or to the particular situation studied, or methods papers that apply standard techniques without breaking new methodological ground. In other words, we attempt to select work that leads to a conceptual advance or a refined understanding of general processes or phenomena (see our policy statement inside the front cover of each Journal issue and an editorial in CJFAS 55(1): 1-2).

We trust you will appreciate that an initial editorial decision avoids the delays of the peer review process, and will allow you to re-submit your manuscript elsewhere. We thank you for your interest in CJFAS and wish you well in finding another outlet for your work.

Yours sincerely,

Don Jackson Editor

The work itself looks pretty good to me and if you wish I'll make a few suggestions about technical additions as well. Spatial notions and ideas are nor foreign to the stock assessment community, and nor are Bayesian ideas now, but *few if any* handle it well. That's the real gap. The idea of a joint spatial-age composition parametric model seems to me likely to be exportable to many other stock assessment projects, so it is important you get this work published and widely read.

Há dois comentários relevantes feitos em apresentações no IPIMAR e num curso do Paulo

1. Existe um viés entre as estimativas amostrais e as geoestatísticas da abundância por ano ! Esta questão está relacionada com o efeito do GLM que produz a abundância calibrada e com a utilização do \beta do modelo espacial para estimar a abundundância. Na prática esta é uma medida diferente da média amostral e não tem que ter a mesma magnitude. Por outro lado o modelo espacial reduz a influência dos clusters de observações muito elevadas o que não acontece com a média amostral, que é muito influenciada por observações extremas. Isto está incuido no paper.

1. Na modelação das composições podia utilizar-se a profundidade para melhorar o ajuste do modelo ! É um desenvolvimento do modelo que deve sr considerado no futuro. Neste trabalho não foi incluido porque a profundidade é redundante com a longitude/latidude devido à forma da costa portuguesa e achei que não deviamos utilizar a mesma informação duas vezes. No entanto, sendo os dois modelos independentes esse não seria um problema. Deviamos incluir um comentário a esta questão.

artigos:ernesto3:discussion