Discussion on the development of spatsampling

ToDo:

FEITO ajustar nomes de argumentos (krig → krige, loc.pred → locations, etc) em conformidade com geoR
FEITO chamadas de likfit(…, messages=FALSE), krige.conv(…, messages=FALSE)
definir/atribuir classes para saidas das funcoes principais: oldClass(lik.results) ← c(“spatsampling”) incluind classe summary.spatsampling
escrever print.spatsampling(), summary.spatsampling() e print.summary.spatsampling() para saída da anealling (e demais)
Fazer funcoes retornarem geodata. PJ informar para Ramiro como fazer o subset.geodata de forma adequada apra que as funcoes retornem geodata com atributos

To think about:

FEITO opções para definir localizações de predição em annealing. A função no momento usa as localizações dos dados originais, mas pode ser interessante considerar: (i) dos dados complementares aos selecionados, (ii) posições definidas pelo usuário
FEITO annealing: interface para definição/procura de temperatura inicial com semântica (chamadas) simplificada
FEITO mensagens onde pode demorar, e.g init.temp() … searching for initial temperature (this can take a while…)
entra sp sai sp , entra geodata sai geodata (?)

mudanças na geoR:

máscara para acomodar sp: máscara geral na geoR, convertendo para geodata e fçs chamariam esta máscara no início?
uma fast.krige.conv(), calculando apenas a variâncias

pensar o que retornar (indices com classe ou geodata)
pensar como definir os métodos (summary, print, plot)
- e.g. plot pode ser: pts selecionados e totais
- summary pode ser do geodata resultante ou do algorítmno
FEITO object.control() documentado separadamente
FEITO verificar \alias{} para todas as fucs documentadas conjuntamente (O pacote já passou por todos os testes do CHECK !)
retirar maxEntropy() para 1a versao até que se resolvam os problemas (?)
FEITO heuristics como soluacao inicial para annealing – passar por objeto/classe
FEITO heuristics para fornecer iniciais para genetico? como selecionar varias (Npop)???
- ideia: roda opcoes do algortimo e completa Npop com mutacoes ????
- ou… para evitar homgeneidade roda opcoes do algortimo e completa Npop com aleatorias
checar se knearneigh() pode ser trocada por near.locations??? da geoR
- A função near.loc da geoR identifica apenas o vizinho mais próximo de cada ponto. A função precisaria ser estendida para identificar os k vizinhos mais próximos de cada ponto
FEITO opcao para usar init.temp externamente e passar para annealing que neste caso pularia o passo (via classe) passando apra o argumento de annealing
criar doc separado para annealing auxiliar (??) incluindo, por ex, init.temp e SA.control