====== Coleção de Materiais sobre Métodos Computacionalmente Intensivos ======
==== Textos ====
* {{projetos:mci:cimnotes.pdf|Notas sobre MCI}}
* {{projetos:mci:cimdata.r|arquivo compatível com R}} com dados das notas sobre MCI acima. Carregue no R com o comando:
source("cimdata.r")
ls(pat=".dat")
* {{projetos:mci:relacoesDistribuicoes.pdf|Grafo das relações entre distribuições univariadas}}
* {{projetos:mci:tabelasPrioris.pdf|A Compendium of Conjugate Priors}}
* {{projetos:mci:catalogNIPriors.pdf|Catalogo de Prioris não Informativas}}
==== Estudos ====
* Máxima Verossimilhança
* Inferência Bayesiana (em desenvolvimento)
* {{projetos:mci:mci.rnw|Entendendo Inferência Bayesiana (Rnw/Tex)}}(28/08/2007) :!: Para compilar este arquivo há a necessidade de estar instalado o pacote 'mtable' no R.
* {{projetos:mci:mci1.pdf|Entendendo Inferência Bayesiana (PDF)}}(28/08/2007)
* Um exemplo de Regressão Linear Simples
* Via Método de Reamostragem Ponderada (30/10/2007)
*{{projetos:mci:dadosreglinear.txt|Dados da Tese de Edson A. A. Silva}}
*{{projetos:mci:reglinear.rnw |Regressão Linear Simples via Reamostragem Ponderada (rnw/tex)}}
*{{projetos:mci:reglinear.pdf|Regressão Linear Simples via Reamostragem Ponderada (PDF)}}
* Via JAGS (12/11/07)
*{{projetos:mci:dadregliponto.txt|Dados da Tese de Edson A. A. Silva (txt)}}
*{{projetos:mci:reglijags.r|reglijags.r - Regressão Linear Simples, Arquivo mãe (.r)}}
*{{projetos:mci:jags.r|jags.r - Arquivo que deve estar no mesmo diretório que reglijags.r }}
*{{projetos:mci:reglijags.bug|reglijags.bug - Arquivo contendo o modelo (.bug)}}
*{{projetos:mci:reglijags.cmd|reglijags.cmd - Arquivo criado por reglijags.r (.cmd)}}
*{{projetos:mci:reglijags-data.r|reglijags-data.r - Arquivo criado por reglijags.r (.r)}}
*{{projetos:mci:reglijags-inits.r|reglijags-inits.r - Arquivo criado por reglijags.r (.r)}}
*{{projetos:mci:codachain1.txt|codachain1.txt - Arquivo de saída, criado por reglijags.r (.txt)}}
*{{projetos:codaindex.txt|codaindex.txt - Arquivo de saída, criado por reglijags.r (.txt)}}
*Via UMacs (22/11/07)
*{{projetos:mci:dadregliponto.txt|Dados da Tese de Edson A. A. Silva (txt)}}
*{{projetos:mci:regliumacs.r|Regressão Linear Simples-UMacs (.R)}}
* Exemplos de Inferência Bayesiana
*{{projetos:mci:modelosnovo.pdf|Modelos Poisson e Espaciais (PDF)-Luiz}} (08/11/07)
* Estimação da precisão de um estimador via Bootstrap - Ana e Guerino (14/01/08)
*{{projetos:mci:boot.r| boot.r - Precisão do estimador (.r)}}
*{{projetos:mci:theta1.r| theta1.r - Arquivo utilizado em boot.r se o estimador é a média (.r)}}
*{{projetos:mci:theta2.r| theta2.r - Arquivo utilizado em boot.r se o estimador é a mediana (.r)}}
*{{projetos:mci:theta3.r| theta3.r - Arquivo utilizado em boot.r se o estimador é a variância (.r)}}
*{{projetos:mci:theta4.r| theta4.r - Arquivo utilizado em boot.r se o estimador é a correlação (.r)}}
*{{projetos:mci:theta5.r| theta5.r - Arquivo utilizado em boot.r se o estimador é a regressão (.r)}}
*{{projetos:mci:boot1.r| boot1.r - Precisão do estimador - uma versão melhorada da anterior (.r)}}
*{{projetos:mci:bootcor.r| bootcor.r - Precisão do estimador correlação-Ana (.r)}}
*{{projetos:mci:bootcorg.r| bootcorg.r - Precisão do estimador correlação-Guerino (.r)}}
*{{projetos:mci:regliboot.r| regliboot.r - Precisão do estimador regressão-Ana (.r)}}
*{{projetos:mci:bootregg.r| bootregg.r - Precisão do estimador regressão-Guerino (.r)}}
*{{projetos:mci:bootseminario.tex| Seminário sobre Boostrap (.tex)}}
* Algoritmo EM
*{{projetos:mci:distmultiem.r| distmultiem.r - Algoritmo EM, Distribuição Multinomial (.r)}}
*{{projetos:mci:emseminario.tex| emseminario.tex - Seminário sobre Algoritmo EM}}
* Um exemplo de regressão linear via Algoritmo EM -Guerino 22/01/08
*{{projetos:mci:dadosem.txt|dadosem.txt}}
*{{projetos:mci:emh.r|emh.r}}
*{{projetos:mci:ordem.r|ordem.r}}
*{{projetos:mci:regressao_em.r|regressao_em.r}}
==== Códigos ====
- Exemplos utilizando funcao MCMCmetrop1R() do pacote 'MCMCpack'
* Modelo Normal com efeito aleatorio
* {{projetos:mci:normalmix.Rnw|Modelo normal misto (.Rnw)}}
* {{projetos:mci:normalmix.pdf|Modelo normal misto (.pdf)}}
* Poisson
* {{projetos:mci:poissonmix.R|Poisson (.R)}}
* CAR
* {{projetos:mci:car0.R|CAR (.R)}}
* Geoestatistico
* {{projetos:mci:geoest.R |Modelo geoestatistico (.R)}}
- Simple linear regression using UMacs package
* {{projetos:mci:lrumacs.r|Simple linear regression using UMacs package (.R)}} (08/11/07)
- Modelos de Inferência Bayesiana via WinBugs
*{{projetos:mci:modelos.zip|Modelos Poisson e Espaciais (.txt)-Luiz }} (08/11/07)
==== Referências ====
@Book{gilks+richardson+spiegelhalter:1996,
author = {Gilks, W. R. and Richardson, S. and Spiegelhalter, D. J. (Ed.)},
title = {Markov Chain Monte Carlo in Practice},
publisher = {Chapman and Hall},
address = {London},
year = {1996}}
@Book{moller:2003,
author = {Jasper M{\o}ller (Ed.)},
title = {Spatial Statistics and Computational Methods},
publisher = {Springer},
year = {2003},
OPTkey = {},
OPTvolume = {},
OPTnumber = {},
series = {Lecture Notes in Statistics},
address = {New York},
OPTedition = {},
OPTmonth = {},
OPTnote = {},
OPTannote = {}
}
@Book{gelman+carlin+stern+rubin:2003,
author = {Gelman, A. and Carlin, J. B. and Stern, H. S. and Rubin, D. B.},
title = {{B}ayesian Data Analysis},
publisher = {Chapman and Hall},
address = {London},
edition = {Second},
year = {2003}
}
@Book{lee:2004,
author = {Lee, Peter N.},
title = {Bayesian Statistics: an introduction},
publisher = {Arnold},
address = {London},
edition = {3},
year = {2004}
}
@Book{robert+casella:2004,
author = {Robert, Christian P. and Casella, George},
title = {Monte Carlo Statistical Methods},
publisher = {Springer},
address = {New York},
edition = {2},
year = {2004}
}
@Book{tanner:1996,
author = {Tanner, M.},
title = {Tools for Statistical Inference},
publisher = {Springer},
address = {New York},
year = {1996}
}
@Book{ohagan:1994,
author = {O'Hagan, A.},
title = {{B}ayesian Inference},
publisher = {Edward Arnold},
year = {1994},
volume = {2b},
series = {Kendall's Advanced Theory of Statistics}
}
@Book{lange:1999,
author = {Lange, Kenneth},
title = {Numerical Analysis for Statisticians},
publisher = {Springer},
address = {New York},
year = {1999}
}
@Article{metropolis+etal:1953,
author = {Metropolis, N. and Rosenbluth, A. W. and Rosenbluth, M. N. and Teller, A. H. and Teller, E.},
title = {Equations of state calculations by fast computing machine},
journal = {Journal of Chemical Physics},
volume = {21},
pages = {1087-1091},
year = {1953}
}