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===== Participantes =====
  - [[pessoais:kelly|Kelly Cristina Cancela]], Mestranda (UFPR)
  - Antonio Rioyei Higa, Prof. Phd 
  - [[pessoais:joel|Joel Maurício Corrêa da Rosa]] , Prof. Dr. (UFPR)
  - [[pessoais:lucianads|Luciana Duque Silva]] ,Doutoranda (UFPR)

===== Objetivo =====

O objetivo deste projeto é desenvolver e reunir metodologias estatísticas ligadas a problemas em Engenharia Florestal.

===== Metodologia =====

Modelos Lineares Generalizados, Testes Paramétricos e Não-Paramétricos, Análise de Sobrevivência, Análise de Séries Temporais, Modelos de Crescimento, Análise de Dados Longitudinais, Regressão por Quantis

===== Experimento - Kelly Cancela =====

{{projetos:apspcs:ed_estudo_1.doc|Estudo 1}}
{{projetos:apspcs:ed_estudo_2.doc|Estudo 2}}
{{projetos:apspcs:ed_estudo_3.doc|Estudo 3}}
{{projetos:apspcs:ed_estudo_4.doc|Estudo 4}}

{{projetos:apspcs:dissertacao250807.doc|Dissertação em 25-08-07}}

{{:pessoais:lduque:dadoslucianaduqueinclinacao.csv|}}===== Experimento - Luciana Duque Silva =====

=== Experimentos de Diferentes Espécie ===

* Espécie - Benthamii
  * Espécie - Dunii

=== Dados do Dendômetro ===

Comparação entre duas famílias/tratamento (há dez séries temporais para cada família) . O objetivo é comparar o crescimento das famílias, distribuídas em 2 blocos (dois ambientes no local). Foram selecionadas 5 famílias de cada planta por bloco.

A luciana quer comparar estas duas famílias (seleção genética, pegou a melhor e a pior em 32 famílias). O que está em questão é medir a diferença entre o crescimento.

* Família 11- 5/bloco3 5/bloco2
  * Familia 24 -6/bloco2 4/bloco3

Variável dependente - Crescimento pelo dendômetro
Variáveis independentes - Copa da árvore (não é medida frequentemente, mas pode ser medida de tempos em tempos),tensão de agua no solo a 30cm de profundidade e a 60cm de profundidade, temperatura, umidade do ar, precipitação(diária), insolação, velocidade do vento (talvez não interfira), dia de geada, estação do ano.

Dar uma olhada em modelos de função de transferência.
delineamento original -32 famílias, 5 repetições

Dados sobre clima no Estado de Santa Catarina, locais : Ponte Serrada, Cacçador e Chapecó (não há média histórica). As variáveis analisadas são Temperatura, Número de Geadas, ...

Primeiro Trabalho - Comparar observações climáticos dos locais acima, feita a partir de 2002, com a média histórica dos ultimos 30 anos.

{{projetos:apspcs:dados_cacador.xls|Dados Climáticos de Caçador}}

{{:pessoais:lduque:dadoslucianaduqueinclinacao.csv|Dados do Dendrômetro}}

<code>

Welch Two Sample t-test

data:  Inclinacao by factor(Familia) 
t = 3.3352, df = 237.873, p-value = 0.0009887
alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 
95 percent confidence interval:
 0.02653859 0.10312808 
sample estimates:
mean in group 11 mean in group 24 
       0.3349167        0.2700833

t.test(Inclinacao[meis==1]~Familia[meis==1])

Welch Two Sample t-test

data:  Inclinacao[meis == 1] by Familia[meis == 1] 
t = 0.4278, df = 17.553, p-value = 0.674
alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 
95 percent confidence interval:
 -0.1215350  0.1835350 
sample estimates:
mean in group 11 mean in group 24 
           0.505            0.474

> t.test(Inclinacao[meis==2]~Familia[meis==2])

Welch Two Sample t-test

data:  Inclinacao[meis == 2] by Familia[meis == 2] 
t = 1.0119, df = 17.996, p-value = 0.325
alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 
95 percent confidence interval:
 -0.08179697  0.23379697 
sample estimates:
mean in group 11 mean in group 24 
           0.347            0.271

> t.test(Inclinacao[meis==3]~Familia[meis==3])

Welch Two Sample t-test

data:  Inclinacao[meis == 3] by Familia[meis == 3] 
t = 1.021, df = 17.133, p-value = 0.3215
alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 
95 percent confidence interval:
 -0.07349969  0.21149969 
sample estimates:
mean in group 11 mean in group 24 
           0.298            0.229

> t.test(Inclinacao[meis==4]~Familia[meis==4])

Welch Two Sample t-test

data:  Inclinacao[meis == 4] by Familia[meis == 4] 
t = 1.605, df = 17.661, p-value = 0.1262
alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 
95 percent confidence interval:
 -0.02796802  0.20796802 
sample estimates:
mean in group 11 mean in group 24 
           0.301            0.211

> t.test(Inclinacao[meis==5]~Familia[meis==5])

Welch Two Sample t-test

data:  Inclinacao[meis == 5] by Familia[meis == 5] 
t = 0.6314, df = 17.51, p-value = 0.5359
alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 
95 percent confidence interval:
 -0.09336618  0.17336618 
sample estimates:
mean in group 11 mean in group 24 
           0.327            0.287

t.test(Inclinacao[meis==6]~Familia[meis==6])

Welch Two Sample t-test

data:  Inclinacao[meis == 6] by Familia[meis == 6] 
t = 1.6165, df = 17.785, p-value = 0.1236
alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 
95 percent confidence interval:
 -0.03188598  0.24388598 
sample estimates:
mean in group 11 mean in group 24 
           0.422            0.316

> t.test(Inclinacao[meis==7]~Familia[meis==7])

Welch Two Sample t-test

data:  Inclinacao[meis == 7] by Familia[meis == 7] 
t = 1.2701, df = 16.575, p-value = 0.2216
alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 
95 percent confidence interval:
 -0.04252069  0.17052069 
sample estimates:
mean in group 11 mean in group 24 
           0.342            0.278

> t.test(Inclinacao[meis==8]~Familia[meis==8])

Welch Two Sample t-test

data:  Inclinacao[meis == 8] by Familia[meis == 8] 
t = 2.1657, df = 17.891, p-value = 0.04409
alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 
95 percent confidence interval:
 0.003334605 0.222665395 
sample estimates:
mean in group 11 mean in group 24 
           0.375            0.262

> t.test(Inclinacao[meis==9]~Familia[meis==9])

Welch Two Sample t-test

data:  Inclinacao[meis == 9] by Familia[meis == 9] 
t = 2.7336, df = 17.958, p-value = 0.01366
alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 
95 percent confidence interval:
 0.02729578 0.20870422 
sample estimates:
mean in group 11 mean in group 24 
           0.207            0.089

> t.test(Inclinacao[meis==10]~Familia[meis==10])

Welch Two Sample t-test

data:  Inclinacao[meis == 10] by Familia[meis == 10] 
t = 0.2025, df = 17.497, p-value = 0.8418
alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 
95 percent confidence interval:
 -0.0939401  0.1139401 
sample estimates:
mean in group 11 mean in group 24 
           0.331            0.321

> t.test(Inclinacao[meis==11]~Familia[meis==11])

Welch Two Sample t-test

data:  Inclinacao[meis == 11] by Familia[meis == 11] 
t = 0.5754, df = 17.598, p-value = 0.5723
alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 
95 percent confidence interval:
 -0.07972366  0.13972366 
sample estimates:
mean in group 11 mean in group 24 
           0.246            0.216

> t.test(Inclinacao[meis==12]~Familia[meis==12])

Welch Two Sample t-test

data:  Inclinacao[meis == 12] by Familia[meis == 12] 
t = 0.5083, df = 17.923, p-value = 0.6175
alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0 
95 percent confidence interval:
 -0.09717278  0.15917278 
sample estimates:
mean in group 11 mean in group 24 
           0.318            0.287

> t.test(Inclinacao~factor(Familia))
</code>

Joel, estou enviando o arquivo com os dados para determinar as correlações existentes entre as inclinações diárias e os dados meteorológicos do ano de 2007. Neste arquivo tem duas planilhas, uma somente com os dados do ano de 2007 e a outra com os dados de 2007 e algumas informações de dezembro de 2006 para determinar as correlações com os dados meteorológicos dos meses anteriores. Qualquer dúvida me escreva.

===== Experimento - Valdeci Constantino =====

Dados sobre crescimento de Pinus Taeda de acordo com diferentes tipos de tratamentos.

{{:projetos:apspcs:croqui_experimento_v1.xls|Croqui do Experimento}}

===== Plano Amostral para Estudo das Raízes =====

Este é um problema em que a determinação do plano amostral e do tamanho de amostra estão restritos aos custos monetários e, principalmente, operacionais ligados à coleta de dados. As variáveis sob as quais desejamos retirar informações são características das raízes finas (fine roots) e grossas (coarse roots) de Pinus Taeda plantadas na área experimental da empresa COMFLORESTA. A principal questão operacional vinculada a retirada das amostras é explicada pela dificuldade de locomoção na área com o "trator", equipamento que arranca a árvore do solo e a coloca em suspensão para que seja analisada a arquitetura da raiz grossa.

A importância no levantamento destas informações está no fato de que a absorção de nutrientes é feita pelas raízes finas e a sustentabilidade no crescimento está vinculada à raiz grossa. As características das raízes finas são expressas pelo peso e forma, enquanto a arquitetura da raiz grossa é mais dificil de ser definida ( ver Danjon e Reubens, 2008 ).

O que chamamos de amostragem aqui, na verdade é uma sub-amostragem feita em cima de árvores localizadas numa área experimental.

Planos amostrais sugeridos : 
  * Seleção de todas as árvores do primeiro bloco para análise de raízes finas e grossas.
  * Seleção de duas árvores por parcela, em toda área do experimento, para análise de raízes finas e grossas.

==== Algumas Questões sobre o Experimento ====

* O padrão de mortes é aleatório no espaço ?
  * As mortes estão relacionadas aos fatores ?
  * Variáveis de raízes finas tem associação com variáveis de raízes grossas ?

==== Dissertação do Valdeci ====

Divisão da dissertação do Valdeci em capítulos.

==== Capítulo 1 ====

O objetivo é verificar a influência dos fatores no desenvolvimento geral da árvore, caracterizado pelo diâmetro e altura.

* Variáveis resposta: Diâmetro, altura e volume, sendo volume uma função de diâmetro e altura.

* Fatores de variação: Responsável pelo plantio (E - Empresa , T - Terceirizado), Sistema de produção de mudas (tubete/55cm3 com 6 meses, tubete/55cm3 com 10 meses, tubete/126cm3 com 6 meses, raiz nua).

Os tratamentos foram aleatorizados em 4 blocos com o objetivo de controlar a variação espacial pois há um leve declive no terreno. No total foram criadas 32 parcelas para receber os 8 tratamentos resultante das possíveis combinações entre os fatores controlados no experimento( Resp.plantio e Sist.prod). 
  
Metodologia Estatística

Será aplicado o modelo ANOVA para dois fatores em blocos inteiramente casualizados, adotando-se algum procedimento para controlar o número de mortos nas parcelas e seu efeito espacial nos resultados, caso este efeito exista. A hipótese existente para este efeito espacial é a de que parcelas com menor número de plantas oferecem mais espaço para o desenvolvimento da planta.

Uma primeira abordagem para minimizar o efeito da  mortalidade é considerar o número de mortos na vizinhança (no máximo podem haver 8 mortos na vizinhança) como uma covariável (sugestão PJ). Devemos ter cuidado para declaração do modelo no R.

As análises de variância serão feitas para diâmetro, altura e volume de forma  UNIVARIADA. Como volume é função de diâmetro e altura, devemos discutir se há necessidade  realmente de repetir a análise para esta variável.

Definir alguns contrastes de interesse (Por exemplo: média dos tubetes  x raiz nua)

==== Capítulo 2 ====

Para o capítulo 2, serão analisadas as características das raízes finas. Para esta finalidade, foi selecionada uma árvore por parcela, totalizando 4 por tratamento. Foi selecionada a árvore no centro da parcela e, quando esta estava morta, selecionou-se a próxima na ordem de numeração crescente de acordo com o croqui do experimento.

* Variáveis resposta: peso em gramas da raízes finas medidas em 4 posições.

Algumas  hipóteses levantadas neste caso. Fatores ambientais podem levar a diferença entre os pesos das raízes finas nas diferentes posições(p1,p2,p3 e p4). Pode haver diferença nos pesos das raízes finas em função do sistema de produção pois espera-se que a raiz nua>tubete/126>tubete/55 10 meses > tubete 55 6 meses. Por hipótese,  a raiz nua tem a tendência em ter melhor desenvolvimento pelas suas características de desenvolvimento no viveiro. Devemos verificar a interação entre a posição e os tratamentos (Será que existe ?????)

Matrizes de correlação para verificar se os pesos.

Definir alguns contrastes de interesse (Por exemplo: média dos tubetes  x raiz nua)

Algumas dúvidas: (As observações nas posições são teoricamente correlacionadas espacialmente !!! Como superar isto ???)

==== Capítulo 3  ====

===== Artigos de Interesse =====

{{projetos:apspcs:artigoglmmdeonbiele.pdf| Artigo sobre Modelos Lineares Generalizados Mistos}}

{{projetos:apspcs:artigocomparacaomultiplanaoparametrica.pdf| Artigo sobre Comparação Múltipla Não-paramétrica}}

{{projetos:apspcs:avaliacaocomparacaomultipla.pdf|Avaliação de Comparações Múltiplas}}

{{projetos:apspcs:survivalgermination.pdf|Análise de Sobrevivência Aplicada à Germinação}}

{{projetos:apspcs:woodyrootarch.pdf|Sobre a Arquitetura de Raízes de Árvores}}

{{:projetos:apspcs:morphologicalfinerootspinus.pdf|Características Morfológicas de Raízes de Pinus Taeda}}

{{:projetos:apspcs:soilrespirationfineroots.pdf|Produção de Raízes Finas sob Fertilização com Nitrogênio}}

{{:projetos:apspcs:praticalregressionr.pdf|Regressão e Anova com o uso do R - Prática}}

===== Links de Interesse =====

{{:projetos:apspcs:plantrootsampling.pdf|Material ilustrativo sobre a amostragem de raízes de planta}}

===== Funções do R =====

[[http://rss.acs.unt.edu/Rdoc/library/pgirmess/html/kruskalmc.html|Post-Hoc após Kruskal Wallis]]

===== Referências Bibliográficas =====
<bibtex>
@Book{cox:2005,
  author =       {Cox,D.R.},
  title =        {Planning of Experiments},
  publisher =    {Wiley-Interscience},
  address =      {},
  year =         {1992},
}
</bibtex>

<bibtex>
@Book{johnson+wichern:1998,
  author =       {Johnson,R.A. and Wichern,D.W.},
  title =        {Applied Multivariate Statistical Analysis},
  publisher =    {Prentice Hall},
  address =      {},
  year =         {1998},
}
</bibtex>

<bibtex>
@Book{montgomery:2001,
  author =       {Montgomery, C.D.},
  title =        {Design and Analysis of Experiments},
  publisher =    {John Wiley & Sons},
  address =      {},
  year =         {2001},
}
</bibtex>

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Resumo da edição

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