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disciplinas:geoesalq:historico [2014/08/15 00:46] – paulojus | disciplinas:geoesalq:historico [2016/12/09 09:18] (atual) – paulojus |
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==== Ano 2014 ==== | ==== Ano 2014 ==== |
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| === Semana 1 === |
* 14/08 | * 14/08 |
* Manhã: apresentação, informações sobre o curso, percepções sobre geoestatística. Introdução ao programa R e ao pacote ''geoR''. Leitura de dados, formato geodata e análises exploratórias. | * Manhã: apresentação, informações sobre o curso, percepções sobre geoestatística. Introdução ao programa R e ao pacote ''geoR''. Leitura de dados, formato geodata e análises exploratórias. |
- Obter outro conjunto de dados geoestatísticos (seu próprio ou em alguma fonte - web etc), carregar no R e efetuar análises | - Obter outro conjunto de dados geoestatísticos (seu próprio ou em alguma fonte - web etc), carregar no R e efetuar análises |
- Reproduzir e discutir as análises feitas com os comandos a seguir: | - Reproduzir e discutir as análises feitas com os comandos a seguir: |
- {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:wolfcamp.txt|arquivo de dados}} e {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:wolf.r|{{:disciplinas:geoesalq:pira2014:wolf.r|de comandos}}}} | - {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:wolfcamp.txt|arquivo de dados}} e {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:wolf.r|de comandos}} |
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| * 15/08 |
| * Manhã: atividades computacionas |
| * Tarde: modelos com covariaveis - tendências com coordenadas e com covariáveis |
| * arquivos utilizados: |
| - {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:ca20-2014.r|ca20}} |
| - {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:bordas.r|definição de bordas}} |
| - {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:wolf.r|wolfcamp revisado}} |
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| === Semana 2 === |
| * 21/08 |
| * Discussão sobre variogramas |
| * Extensões dos modelos considerando covariáveis e transformações |
| * Apresentação e discussão de trabalhos, dados e projetos de participantes |
| * 22/08 |
| * Manhã |
| * {{:disciplinas:geoesalq:modelos-pr.r|alguns modelos para dados de precipitação no PR}} |
| * {{:disciplinas:geoesalq:modelo-ca20.r|alguns modelos para dados Ca20}} |
| * Exemplo de código básico para predição espacial ({{:disciplinas:geoesalq:ex-predicao.r|arquivo de comandos}}), incluindo exportação dos resultados |
| * {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:krigacamg.r|Um exemplo mais completo de comandos para análise}} |
| * {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:regioes.dat|arquivo de dados}} utilizados no arquivo de comandos |
| * Tarde |
| * além de krigagem: Simulações da preditiva (condicionais) |
| * {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:comandos-intro-2014.r|arquivo de comandos atualizado}} |
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| === Semana 3 === |
| * 18/09 |
| * Manhã: |
| - simulação e funções de correlação |
| - estimação por verossimilhança |
| * Tarde |
| - Predição espacial e efeitos do modelo na predição |
| - inferência e predição Bayesiana |
| * 19/09 |
| * Manhã: |
| - {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:aula-2014-09-18.r|arquivo com comandos da aula do dia anterior}} - revisão, alterar e expandir os comandos |
| - Mais simulações: {{:disciplinas:geoesalq:comandos-simula.r|arquivo 2}} simulações do modelo geoestatístico básico no R, feitas de várias formas |
| - {{:disciplinas:geoesalq:pira2012:comandosintro.r|arquivo de comandos}} de uma análise incluindo inferência Bayesiana |
| * Tarde: |
| - Modelos não gaussianos. |
| - {{:disciplinas:geoesalq:simular-glgm.r|arquivo 5}} Simulação de modelos GLM geoestatísticos (Poisson e Binomial) |
| - Análises usando a geoRglm: |
| * {{:disciplinas:geoesalq:poisson-sim.r|Análise com o modelo Poisson geoestatístico}} |
| * {{:disciplinas:geoesalq:binario-1d.r|arquivo com código}} para exemplo de simulação e análise de dados binários em 1-D |
| * {{:disciplinas:geoesalq:simbin.txt|arquivo de dados binários}} para análise com geoRglm |
| - Representação de dados espaciais no R pelo pacote sp. SpatialPolygons e algumas visualizações e análises de dados de áreas |
| - {{:disciplinas:geoesalq:pira2014:aucklandnew.r|Arquivo de comandos visto na aula}} |
| - Convertendo um objeto de áreas/polígonos em geodata (centroides como coordenadas) |
| * {{:disciplinas:geoesalq:area2geo.r|arquivo de comandos}} |
| * Arquivos shapefile {{:disciplinas:cieg:bairros.shp|}} {{:disciplinas:cieg:bairros.shx|}} {{:disciplinas:cieg:bairros.dbf|}} |
| * {{:disciplinas:cieg:tabe.csv|Atributos dos bairros}} |
| - Montar geodata a partir da importação de dados de centroides de municípios do Paraná |
| * shape com o estado do PR ({{:disciplinas:geoesalq:41uf2500g.dbf|arquivo dbf}}, {{:disciplinas:geoesalq:41uf2500g.shp|arquivo shp}}, {{:disciplinas:geoesalq:41uf2500g.shx|arquivo shx}}) |
| * shape com os municípios do PR ({{:disciplinas:geoesalq:41mu2500g.dbf|arquivo dbf}}, {{:disciplinas:geoesalq:41mu2500g.shp|arquivo shp}}, {{:disciplinas:geoesalq:41mu2500g.shx|arquivo shx}}) |
| * {{:disciplinas:geoesalq:prodsoja.txt|arquivo de atributos}} |
| * {{:disciplinas:geoesalq:rotina.r|Script de análise}} |
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| === Semana 4 === |
| * 09/10: Estudos de caso, extensões e outras análises (processos pontuais e áreas) |
| * Manhã: |
| * SKATER |
| * Análise espacial de experimentos |
| * Dados composicionais (frações de solo) |
| * {http://www.ij-healthgeographics.com/content/10/1/17|Padrão espacial na resistência a antibióticos - EUREQA} |
| * Tarde: |
| * Abundância por classes de idade (pescada) |
| * Zona de captura |
| * Relação de variáveis de solo e ocorrência de espécies (Djair) |
| * Processos pontuais (princípios e conceitos básicos) |
| * 10/10 |
| * Tarde: |
| * Apresentação e discussão de análises, temas e projetos de participantes do curso |
| * Modelo/código para Análise conjunta de diversas áreas |
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==== Ano 2012 ==== | ==== Ano 2012 ==== |
* Arquivos de comandos com exemplos de análises (examinar antes da próxima aula) | * Arquivos de comandos com exemplos de análises (examinar antes da próxima aula) |
- {{:disciplinas:geoesalq:dadosmalha.txt|arquivo de dados usado no script}} | - {{:disciplinas:geoesalq:dadosmalha.txt|arquivo de dados usado no script}} |
* {{:disciplinas:geoesalq:porot.r|Comandos vistos em aula}} para pororidade total | * {{:disciplinas:geoesalq:porot.r|Comandos vistos em aula}} para porosidade total |
* {{:disciplinas:geoesalq:aula1-2009.r|Outro arquivo de comandos}} para estes dados | * {{:disciplinas:geoesalq:aula1-2009.r|Outro arquivo de comandos}} para estes dados |
- {{:disciplinas:geoesalq:profund020a.txt|arquivo de dados de teores de elementos}} em camada 0-20{{:disciplinas:geoesalq:pira2012:acacio-artigo1.pdf|}} | - {{:disciplinas:geoesalq:profund020a.txt|arquivo de dados de teores de elementos}} em camada 0-20{{:disciplinas:geoesalq:pira2012:acacio-artigo1.pdf|}} |
- {{:disciplinas:geoesalq:sal.dat|dados de salinidade de água}} | - {{:disciplinas:geoesalq:sal.dat|dados de salinidade de água}} |
- {{:disciplinas:geoesalq:quimicos_c1.txt|arquivo com teores de elementos quimicos}} em amostras de solo | - {{:disciplinas:geoesalq:quimicos_c1.txt|arquivo com teores de elementos químicos}} em amostras de solo |
* Sugestão de leitura {{:disciplinas:geoesalq:cap3.pdf|Cap 3 de Diggle & Ribeiro}} | * Sugestão de leitura {{:disciplinas:geoesalq:cap3.pdf|Cap 3 de Diggle & Ribeiro}} |
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* 05/10 | * 05/10 |
* Manhã: Representaçao e dados espaciais | * Manhã: Representação e dados espaciais |
- Convertendo um objeto de áreas/polígonos em geodata (centroides como coordenadas) | - Convertendo um objeto de áreas/polígonos em geodata (centroides como coordenadas) |
* {{:disciplinas:geoesalq:area2geo.r|arquivo de comandos}} | * {{:disciplinas:geoesalq:area2geo.r|arquivo de comandos}} |
- algumas aplicações de geoestatística: análise espacial de experimentos e ánalises conjuntas | - algumas aplicações de geoestatística: análise espacial de experimentos e ánalises conjuntas |
* tarde: | * tarde: |
- interpolações não eapaciais ({{:disciplinas:geoesalq:interpgeo.r|arquivo de comandos com exemplos e alternativas}}) | - interpolações não espaciais ({{:disciplinas:geoesalq:interpgeo.r|arquivo de comandos com exemplos e alternativas}}) |
- apresentação alunos (ver material) | - apresentação alunos (ver material) |
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* {{disciplinas:ce714:r:aula3pira.r|Arquivo com comandos do R}} com análise geoestatística utilizados durante aula | * {{disciplinas:ce714:r:aula3pira.r|Arquivo com comandos do R}} com análise geoestatística utilizados durante aula |
* outro {{disciplinas:ce714:r:aula4pira.r|arquivo com comandos do R}} com análise geoestatística utilizados durante aula | * outro {{disciplinas:ce714:r:aula4pira.r|arquivo com comandos do R}} com análise geoestatística utilizados durante aula |
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