Diferenças
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disciplinas:ce089-2014-02 [2014/08/06 15:51] – walmes | disciplinas:ce089-2014-02 [2014/12/15 14:16] (atual) – walmes | ||
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Linha 3: | Linha 3: | ||
//"The purpose of computing is insight, not numbers."// | //"The purpose of computing is insight, not numbers."// | ||
- | {{ http:// | + | {{ http:// |
==== Detalhes da oferta da disciplina ==== | ==== Detalhes da oferta da disciplina ==== | ||
Linha 22: | Linha 22: | ||
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+ | /* | ||
==== Histórico das Aulas do Curso ==== | ==== Histórico das Aulas do Curso ==== | ||
+ | |||
+ | {{ http:// | ||
+ | |||
- 04/08: | - 04/08: | ||
Linha 32: | Linha 35: | ||
* Método da congruência; | * Método da congruência; | ||
* Método da transformação integral da probabilidade; | * Método da transformação integral da probabilidade; | ||
+ | - 18/08: | ||
+ | * Como escrever documentos R+Markdown, por Vanessa Sehaber e Henrique Laureano. | ||
+ | - 20/08: | ||
+ | * Método de aceitação e rejeição. | ||
+ | - 25/08: | ||
+ | * Método Box-Muller para gerar números aleatórios da distribuição Gaussiana. | ||
+ | - 27/08: | ||
+ | * Métodos de geração de números aleatórios baseados em MCMC. | ||
+ | * Amostrador independente (independence sampler). | ||
+ | * Metropolis Random-Walk. | ||
+ | - 01/09: | ||
+ | * Teste de hipótese Monte Carlo. | ||
+ | - 03/09: | ||
+ | * Avaliação do nível de significância nominal de testes de hipótese. | ||
+ | - 10/09: | ||
+ | * Nível de cobertura de intervalos de confiança. | ||
+ | - 15/09: | ||
+ | * Avaliação via simulação do poder de testes paramétricos e não paramétricos na presença e ausência dos pressupostos. | ||
+ | - 17/09: | ||
+ | * Avaliação via simulação do poder de testes paramétricos e não paramétricos na presença e ausência dos pressupostos. | ||
+ | - 22/09: | ||
+ | * Nível de cobertura de intervalos de confiança - intervalos baseados na deviance a na sua aproximação (Wald). | ||
+ | - 24/09: | ||
+ | * Nível de cobertura de intervalos de confiança - efeito da parametrização. | ||
+ | - 29/09: | ||
+ | * Desenvolvimento do trabalho 03. | ||
+ | - 01/10: | ||
+ | * Desenvolvimento do trabalho 03. | ||
+ | - 13/10: | ||
+ | * Método Newton-Raphson. | ||
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+ | |||
+ | */ | ||
+ | |||
+ | <code R> | ||
+ | ## | ||
+ | |||
+ | require(bbmle) | ||
+ | |||
+ | ## | ||
+ | |||
+ | y <- rnorm(100, mean=0, sd=1) | ||
+ | crt <- 1.5 | ||
+ | r <- y<crt | ||
+ | y[!r] <- crt | ||
+ | r <- as.integer(r) | ||
+ | plot(ecdf(y)) | ||
+ | table(r) | ||
+ | |||
+ | ll <- function(theta, | ||
+ | ys <- split(y, r) | ||
+ | ll1 <- dnorm(ys[[" | ||
+ | | ||
+ | | ||
+ | | ||
+ | ll2 <- pnorm(ys[[" | ||
+ | | ||
+ | | ||
+ | | ||
+ | | ||
+ | ll12 <- sum(ll1)+sum(ll2) | ||
+ | ## Tem que retornar o negativo da soma. A mle2() minimiza. | ||
+ | return(-ll12) | ||
+ | } | ||
+ | |||
+ | ## | ||
+ | ## Estimação com a bbmle. | ||
+ | |||
+ | parnames(ll) <- c(" | ||
+ | m0 <- mle2(minuslogl=ll, | ||
+ | | ||
+ | |||
+ | coef(m0) | ||
+ | summary(m0) | ||
+ | ci <- confint(m0, method=" | ||
+ | ci | ||
+ | |||
+ | htheta <- coef(m0) | ||
+ | logL <- c(logLik(m0)) | ||
+ | |||
+ | ## | ||
+ | |||
+ | llv <- Vectorize( | ||
+ | FUN=function(th1, | ||
+ | -ll(c(th1, th2), y=y, r=r) | ||
+ | }, | ||
+ | vectorize.args=c(" | ||
+ | |||
+ | th1 <- seq(-0.4, 0.4, l=30) | ||
+ | th2 <- seq(-0.1, 0.4, l=30) | ||
+ | |||
+ | lla <- outer(th1, th2, llv, y=y, r=r) | ||
+ | |||
+ | contour(th1, | ||
+ | xlab=expression(mu), | ||
+ | ylab=expression(log(sigma))) | ||
+ | abline(v=htheta[1], | ||
+ | contour(th1, | ||
+ | levels=(logL-0.5*qchisq(0.95, | ||
+ | col=2) | ||
+ | abline(v=ci[1, | ||
+ | |||
+ | plot(profile(m0)) | ||
+ | |||
+ | |||
+ | ## | ||
+ | ## Implementação conforme sugestão do Wikipedia. | ||
+ | |||
+ | require(rootSolve) | ||
+ | |||
+ | n <- rbinom(1, size=200, p=0.8) | ||
+ | y <- c(rpois(n, lambda=exp(2)), | ||
+ | length(y) | ||
+ | |||
+ | barx <- mean(y) | ||
+ | p <- sum(y==0)/ | ||
+ | |||
+ | f <- function(lambda, | ||
+ | L$barx*(1-exp(-lambda))-lambda*(1-L$p) | ||
+ | } | ||
+ | |||
+ | L <- list(barx=barx, | ||
+ | gradient(f, x=2, L=L) | ||
+ | |||
+ | curve(f(x, L=L), 0, 15); abline(h=0) | ||
+ | |||
+ | ## Newton-Raphson. | ||
+ | maxiter <- 50; i <- 1 ## Número máximo de iterações e contador. | ||
+ | tol <- 1e-5; error <- 100*tol | ||
+ | theta <- matrix(NA, nrow=1, ncol=1) | ||
+ | theta[1,] <- barx | ||
+ | while(i <= maxiter & error> | ||
+ | theta <- rbind(theta, | ||
+ | G <- f(theta[i, | ||
+ | H <- gradient(f=f, | ||
+ | theta[i+1,] <- theta[i, | ||
+ | error <- sum(abs((theta[i+1, | ||
+ | i <- i+1 | ||
+ | ## print(c(theta[i, | ||
+ | print(cbind(H, | ||
+ | } | ||
+ | |||
+ | lam <- theta[i, | ||
+ | pii <- 1-barx/ | ||
+ | |||
+ | ## | ||
+ | ## Vendo os contornos da verossimilhança. | ||
+ | |||
+ | llmax <- ll(th=c(log(pii/ | ||
+ | |||
+ | th1 <- seq(-7, 5, l=50) | ||
+ | th2 <- seq(-1, 4, l=50) | ||
+ | lla <- outer(th1, th2, llv, y=y) | ||
+ | |||
+ | contour(th1, | ||
+ | ## levels=seq(from=llmax-30, | ||
+ | nlevels=20, | ||
+ | xlab=" | ||
+ | ylab=" | ||
+ | abline(v=log(pii/ | ||
+ | |||
+ | </ | ||
==== Links úteis ==== | ==== Links úteis ==== | ||
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+ | - Instruções de como enviar os trabalhos/ | ||
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==== Avaliações ==== | ==== Avaliações ==== | ||
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+ | * Trabalho 1: {{http:// | ||
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