Diferenças
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dicas:ccad [2010/07/22 19:16] – paulojus | dicas:ccad [2011/10/07 11:32] (atual) – paulojus | ||
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Linha 20: | Linha 20: | ||
* O usuário cadastrado receberá email com login e senha de acesso. | * O usuário cadastrado receberá email com login e senha de acesso. | ||
* o acesso deve ser feito sempre à servidora '' | * o acesso deve ser feito sempre à servidora '' | ||
- | * a partir desta servidora é possível acessar as demais máquinas do LCPAD via o comando '' | ||
* O acesso à servidora | * O acesso à servidora | ||
$ ssh LOGIN@ccad.ufpr.br</ | $ ssh LOGIN@ccad.ufpr.br</ | ||
Linha 79: | Linha 78: | ||
#PBS -m ae | #PBS -m ae | ||
#PBS -M paulojus@leg.ufpr.br | #PBS -M paulojus@leg.ufpr.br | ||
+ | #PBS -l walltime=6: | ||
cd $PBS_O_WORKDIR | cd $PBS_O_WORKDIR | ||
Linha 85: | Linha 85: | ||
ccad:~> qsub run.sh </ | ccad:~> qsub run.sh </ | ||
- Monitorar o progresso com< | - Monitorar o progresso com< | ||
- | ccad:~> qstat run.sh</ | + | ccad:~> qstat </ |
- E também monitorar da forma usual o arquivo de saída do R< | - E também monitorar da forma usual o arquivo de saída do R< | ||
ccad:~> tail -f seu_programa.Rout | ccad:~> tail -f seu_programa.Rout | ||
Linha 95: | Linha 95: | ||
O CCAD disponibiliza informações adicionais sobre [[http:// | O CCAD disponibiliza informações adicionais sobre [[http:// | ||
Se tiverem dicas de uso para o R coloquem aqui!!! | Se tiverem dicas de uso para o R coloquem aqui!!! | ||
+ | |||
+ | === Tempo de processamento === | ||
+ | |||
+ | Por //default// o CCAD interrompe os processos após uma (1) hora de processamento. | ||
+ | No exemplo de arquivo '' | ||
+ | este tempo, para seis (6) horas, incluindo no seu arquivo: | ||
+ | #PBS -l walltime=6: | ||
+ | Ajuste este tempo de acordo com a sua necessidade. | ||
=== Pacotes do R === | === Pacotes do R === | ||
- | Pacotes adicionais podem ser instlados | + | Pacotes adicionais podem ser instalados |
Entretanto para evitar replicação de instalações estamos centralizando a instalação de pacotes na conta de PJ. | Entretanto para evitar replicação de instalações estamos centralizando a instalação de pacotes na conta de PJ. | ||
O módulo do R ('' | O módulo do R ('' |