Diferenças
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| dicas:ccad [2010/07/22 19:16] – paulojus | dicas:ccad [2011/10/07 11:32] (atual) – paulojus | ||
|---|---|---|---|
| Linha 20: | Linha 20: | ||
| * O usuário cadastrado receberá email com login e senha de acesso. | * O usuário cadastrado receberá email com login e senha de acesso. | ||
| * o acesso deve ser feito sempre à servidora '' | * o acesso deve ser feito sempre à servidora '' | ||
| - | * a partir desta servidora é possível acessar as demais máquinas do LCPAD via o comando '' | ||
| * O acesso à servidora | * O acesso à servidora | ||
| $ ssh LOGIN@ccad.ufpr.br</ | $ ssh LOGIN@ccad.ufpr.br</ | ||
| Linha 79: | Linha 78: | ||
| #PBS -m ae | #PBS -m ae | ||
| #PBS -M paulojus@leg.ufpr.br | #PBS -M paulojus@leg.ufpr.br | ||
| + | #PBS -l walltime=6: | ||
| cd $PBS_O_WORKDIR | cd $PBS_O_WORKDIR | ||
| Linha 85: | Linha 85: | ||
| ccad:~> qsub run.sh </ | ccad:~> qsub run.sh </ | ||
| - Monitorar o progresso com< | - Monitorar o progresso com< | ||
| - | ccad:~> qstat run.sh</ | + | ccad:~> qstat </ |
| - E também monitorar da forma usual o arquivo de saída do R< | - E também monitorar da forma usual o arquivo de saída do R< | ||
| ccad:~> tail -f seu_programa.Rout | ccad:~> tail -f seu_programa.Rout | ||
| Linha 95: | Linha 95: | ||
| O CCAD disponibiliza informações adicionais sobre [[http:// | O CCAD disponibiliza informações adicionais sobre [[http:// | ||
| Se tiverem dicas de uso para o R coloquem aqui!!! | Se tiverem dicas de uso para o R coloquem aqui!!! | ||
| + | |||
| + | === Tempo de processamento === | ||
| + | |||
| + | Por //default// o CCAD interrompe os processos após uma (1) hora de processamento. | ||
| + | No exemplo de arquivo '' | ||
| + | este tempo, para seis (6) horas, incluindo no seu arquivo: | ||
| + | #PBS -l walltime=6: | ||
| + | Ajuste este tempo de acordo com a sua necessidade. | ||
| === Pacotes do R === | === Pacotes do R === | ||
| - | Pacotes adicionais podem ser instlados | + | Pacotes adicionais podem ser instalados |
| Entretanto para evitar replicação de instalações estamos centralizando a instalação de pacotes na conta de PJ. | Entretanto para evitar replicação de instalações estamos centralizando a instalação de pacotes na conta de PJ. | ||
| O módulo do R ('' | O módulo do R ('' | ||